"Điều ước của Miki Sayaka đã thành hiện thực, và cô đã trở thành Ma pháp thiếu nữ. Tuy nhiên cái giá phải trả là quá lớn cùng những hậu quả không lường trước được đã khiến Ngọc hồn của cô bị vẩn đục. Khi Ngọc hồn bị vẩn đục, nó sẽ biến thành Khổ mầm và Ma pháp thiếu nữ sẽ tái sinh thành Ma nữ. Đó là số phận của tất cả những người đã lập giao ước với Kyubey. Madoka cũng không thoát khỏi số phận đó, và đó là lý do Homura liên tiếp quay ngược dòng thời gian để tìm cách cứu Madoka."