Một điệp viên xâm nhập vào cơ quan cảnh sát quốc gia Nhật Bản, lấy lại các tập tin bí mật của Mi6 của Anh, CIA và FBI của Đức và Mỹ. Rei Furuya và một nhóm PSB của cảnh sát Tokyo đã chặn Spy trong nơi nghỉ ngơi, và ngay trước tai nạn xe hơi lớn, đặc vụ FBI Shuichi Akai đã bắn tỉa và đâm vào phương tiện của Spy. Ngày hôm sau, tại Thủy cung ở Tokyo với bánh xe Ferris, Conan và các chàng trai thám tử tìm thấy một người phụ nữ có heterochromia Iris bị mất trí nhớ và có một chiếc điện thoại di động bị hỏng. Quyết định ở lại và giúp người phụ nữ lấy lại ký ức, Conan và các chàng trai thám tử nằm dưới con mắt cảnh giác của Vermouth.